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    <init id="RandomTree.t:G_VII_pre2003_msa" spec="beast.evolution.tree.RandomTree" estimate="false" initial="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" taxa="@G_VII_pre2003_msa">
        <populationModel id="ConstantPopulation0.t:G_VII_pre2003_msa" spec="ConstantPopulation">
            <parameter id="randomPopSize.t:G_VII_pre2003_msa" name="popSize">1.0</parameter>
        </populationModel>
    </init>

    <distribution id="posterior" spec="util.CompoundDistribution">
        <distribution id="prior" spec="util.CompoundDistribution">
            <distribution id="YuleModel.t:G_VII_pre2003_msa" spec="beast.evolution.speciation.YuleModel" birthDiffRate="@birthRate.t:G_VII_pre2003_msa" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa"/>
            <prior id="YuleBirthRatePrior.t:G_VII_pre2003_msa" name="distribution" x="@birthRate.t:G_VII_pre2003_msa">
                <Uniform id="Uniform.1" name="distr" upper="Infinity"/>
            </prior>
        </distribution>
        <distribution id="likelihood" spec="util.CompoundDistribution" useThreads="true">
            <distribution id="treeLikelihood.G_VII_pre2003_msa" spec="ThreadedTreeLikelihood" data="@G_VII_pre2003_msa" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa">
                <siteModel id="SiteModel.s:G_VII_pre2003_msa" spec="SiteModel">
                    <parameter id="mutationRate.s:G_VII_pre2003_msa" estimate="false" name="mutationRate">1.0</parameter>
                    <parameter id="gammaShape.s:G_VII_pre2003_msa" estimate="false" name="shape">1.0</parameter>
                    <parameter id="proportionInvariant.s:G_VII_pre2003_msa" estimate="false" lower="0.0" name="proportionInvariant" upper="1.0">0.0</parameter>
                    <substModel id="JC69.s:G_VII_pre2003_msa" spec="JukesCantor"/>
                </siteModel>
                <branchRateModel id="StrictClock.c:G_VII_pre2003_msa" spec="beast.evolution.branchratemodel.StrictClockModel">
                    <parameter id="clockRate.c:G_VII_pre2003_msa" estimate="false" name="clock.rate">1.0</parameter>
                </branchRateModel>
            </distribution>
        </distribution>
    </distribution>

    <operator id="YuleBirthRateScaler.t:G_VII_pre2003_msa" spec="ScaleOperator" parameter="@birthRate.t:G_VII_pre2003_msa" scaleFactor="0.75" weight="3.0"/>

    <operator id="YuleModelTreeScaler.t:G_VII_pre2003_msa" spec="ScaleOperator" scaleFactor="0.5" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="3.0"/>

    <operator id="YuleModelTreeRootScaler.t:G_VII_pre2003_msa" spec="ScaleOperator" rootOnly="true" scaleFactor="0.5" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="3.0"/>

    <operator id="YuleModelUniformOperator.t:G_VII_pre2003_msa" spec="Uniform" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="30.0"/>

    <operator id="YuleModelSubtreeSlide.t:G_VII_pre2003_msa" spec="SubtreeSlide" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="15.0"/>

    <operator id="YuleModelNarrow.t:G_VII_pre2003_msa" spec="Exchange" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="15.0"/>

    <operator id="YuleModelWide.t:G_VII_pre2003_msa" spec="Exchange" isNarrow="false" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="3.0"/>

    <operator id="YuleModelWilsonBalding.t:G_VII_pre2003_msa" spec="WilsonBalding" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa" weight="3.0"/>

    <logger id="tracelog" fileName="G_VII_pre2003_msa.log" logEvery="1000" model="@posterior" sanitiseHeaders="true" sort="smart">
        <log idref="posterior"/>
        <log idref="likelihood"/>
        <log idref="prior"/>
        <log idref="treeLikelihood.G_VII_pre2003_msa"/>
        <log id="TreeHeight.t:G_VII_pre2003_msa" spec="beast.evolution.tree.TreeHeightLogger" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa"/>
        <log idref="YuleModel.t:G_VII_pre2003_msa"/>
        <log idref="birthRate.t:G_VII_pre2003_msa"/>
    </logger>

    <logger id="screenlog" logEvery="1000">
        <log idref="posterior"/>
        <log id="ESS.0" spec="util.ESS" arg="@posterior"/>
        <log idref="likelihood"/>
        <log idref="prior"/>
    </logger>

    <logger id="treelog.t:G_VII_pre2003_msa" fileName="$(tree).trees" logEvery="1000" mode="tree">
        <log id="TreeWithMetaDataLogger.t:G_VII_pre2003_msa" spec="beast.evolution.tree.TreeWithMetaDataLogger" tree="@Tree.t:G_VII_pre2003_msa"/>
    </logger>

</run>

</beast>
